私がサイト作成時に悩んだことだったのですが、ヘッダー画像の左右に変な余白（上の画像の左右端↑）ができてしまい、解決策がなかなか見つかりませんでした。
「カスタマイズ」の「全体カラー設定」で、
「(1)全体的に反映：有効化すると「デフォルト」表示のカラー変更ができなくなります」
を選択すると直ることから、カスタマイズのどこかの設定がおかしくなっているのかなとは思ったのですが。
ようやく解決したので、ここに解決法を記しておきます。
ヘッダーの左右の余白をなくす方法
結論からいうと。
外観➡カスタマイズ➡基本エリア設定➡背景色➡サイト背景色
「サイト背景色」をクリアする。
サイト背景色を設定してはいけません！
私は、背景色を白にしたかったので、「背景色」も「サイト背景色」も白に設定していました。
でも、ここにちゃんと書いてありますね。
「サイト全体を包括する背景色です※色を設定すると幅のMAX値は1100pxになります」
というわけで、説明はちゃんと読みましょう(笑)